В 1611 преемником Киевского митрополита был избран и хиротонисан в епископы иеромонах Виленского монастыря Иосиф Вельямин Рутский. Воспитанный в протестантском духе, он познакомился с иезуитами и присоединился к Римской церкви. Ему посоветовали поступить в Греческую коллегию Св. Афанасия в Риме, по окончании которой он вернулся в обряд своих предков и поступил в число братии Виленского Троицкого монастыря.

В следующем 1612 в этой обители остановился московский патриарх Игнатий, изгнанный из Москвы за сотрудничество с самозванцами. Настоятель монастыря епископ Иосиф дал ему книги в защиту Флорентийской унии на греческом языке (Игнатий был греком по происхождению). Прочитав их, Игнатий тайно присоединился к унии, сложил исповедание веры и присягу на верность Папе. В ноябре, когда польская армия Сигизмунда и его сына Владислава вновь вступила в Россию, Игнатий на короткое время вернулся на московскую кафедру. После смещения Филаретом Романовым он вновь вернулся в Свято-Троицкий монастырь, где по описаниям насельников, вел строгую аскетическую жизнь до своей смерти в 1620 году. К унии присоединился его личный секретарь Эммануил Кантакузен, который позже был помощником у архиепископа Иосафата Кунцевича. Иосиф Рутский обсуждал с Игнатием как обратить Московию к Римскому престолу.

В 1613 году после смерти Ипатия Потия на митрополичий престол взошел Рутский. Он пытался примирить униатов и православных, вместе со своим помощником Иосафатом Кунцевичем ездил в Киев, где увещевал белое духовенство и братию Печерского монастыря помириться с Римом.

По просьбе Рутского король даровал митрополии право создавать народные школы при монастырях. Вскоре такие школы были открыты в Полоцке, Красноборе, Жировицах, Борине и Черени, а несколько позднее - в Белой, Могилеве и Холме. В Новогрудке митрополит основал на свои средства школу для детей мещан и шляхты с преподаванием философии и теологии (в 1624 г. она была преобразована в духовную семинарию). Позднее подобная школа была организована в Минске при монастыре Косьмы и Дамиана. Уже после смерти митрополита Иосифа школа была организована в Холме. В программу этих школ входило обучение церковнославянскому языку, изучение и толкование Отцов Церкви, переводы с греческого языка и латыни, начатки семи свободных искусств до риторики включительно. Основы веры преподавались по катехизису, написанному о. Петром Аркудием на основе творений восточных Отцов церкви.

В 1615 Рутский ездил в Апостольскую столицу, где добился 22 стипендии для обучения русинских кандидатов в Риме. Курия дала ему право открывать в Украине школы с правами иезуитских коллегий.

В 1617 году монашествующие из 5 униатских монастырей собрались на съезд и основали конгрегацию Пресвятой Троицы . В основу конституции были положены аскетические правила Св. Василия Великого, поэтому монахи назвали себя василианами, а свое братство Чином Святого Василия Великого (ЧСВВ).