Тем не менее, насколько можно судить сегодня, алхимия в значительной степени базировалась на неорганической химии. Алхимикам были довольно неплохо известны многие процессы, легшие в основу современной науки химии. Один из наиболее выдающихся представителей алхимии – Парацельс, швейцарский ученый, трудившийся во второй половине XV в. Парацельс был не только алхимиком, но и врачом. В то время, как «традиционная» медицина признавала в качестве лекарственных препаратов в основном травы и их смеси, Парацельс, экспериментировавший с неорганическими элементами, первым стал применять во врачебной практике соединения мышьяка, сурьмы, ртути – веществ, традиционно использовавшихся в алхимии. Более того, добившись немалых успехов, Парацельс выдвинул ряд революционных тезисов, касавшихся развития медицины.

Рис. 210 [Илл. – «Алхимик». Гравюра Питера Брейгеля.    XVI в. (Детский Плутарх, стр. 466 нижн. рис.)]

Основным положением медицинской теории Парацельса была мысль о том, что человек – ничто иное, как ряд определенных химических элементов, каждый из которых соответствует определенному внутреннему органу. Из этого следовало, во-первых, что человека следует лечить не травами, а химическими препаратами (давний принцип «лечить подобное подобным»), а во вторых, человека возможно изготовить искусственным путем, смешав нужные химические элементы и создав им необходимые условия. Теория Парацельса, по большому счету, была частью той тяги к познанию и к рационалистическому объяснению человеческой природы, которую начали итальянские гуманисты. В то же время, Парацельс был последователем алхимической традиции, в которой был силен  средневековый символизм и идеализм. В пропаганде своих идей он дошел до того, что публично призывал отказаться от учения Авиценны и Гиппократа, двух величайших авторитетов средневековой медицины.