Умеренные, как и следовало ожидать, вскоре встали во главе движения и составили свою программу, базировавшуюся на «12 статьях». Названная Гейльброннской (по месту ее написания), она представляла собой проект реформы всей империи. В программе предлагалось лишить крупных князей независимости, поставить их на государственную службу. Программа декларировала всеобщее равенство граждан страны перед законом, а закон предполагалось составить на основе проверенного веками римского права. «12 статей» были программой крестьянства, Гейльброннская программа стала манифестом рыцарей и бюргерства, стремившихся усилить позиции городов и ослабить власть крупных феодалов.

Рис. 39 [Илл. – Немецкие крестьяне. Гравюра А. Дюрера. XVI в. (Детский Плутарх, стр. 236 нижн. прав. рис.)]

В области церковной реформы франконцы зашли еще дальше, чем швабские крестьяне. Они призвали не только ввести выборность священников, но и лишить духовенство какой бы то ни было светской власти, закрыть монастыри и упразднить все монашеские и рыцарские ордены. Вдобавок, франконцы требовали секуляризовать всю собственность католической церкви и передать ее общинам, которые должны были сами содержать своих священников.

Гейльброннская программа стала наиболее полным документом, касавшимся буквально всех сторон жизни Германии. Бюргеры, участвовавшие в восстании, ввели в программу проекты денежной и промышленной реформ. В частности, они предлагали ввести единую монету для всей страны, упорядочить систему мер и запретить феодалам устанавливать в своих областях таможенные пошлины и поборы, сильно затруднявшие торговлю. Вендель Гиплер, основной автор Гейльброннской программы, проявил себя  как грамотный экономист и политик. Целью программы (и вполне реальным результатом при условии полного выполнения всех ее пунктов) должно было стать сильное централизованное государство, возрожденная империя, в которой ведущую роль играло бы не дворянство, а бюргеры.

Вожди восставших собирались подробно обсудить проект программы, чтобы затем преподнести его императору и просить о проведении имперской реформы. Но в это время армия Швабского союза, разгромившая восстание в своей области, пришла на помощь  франконским феодалам, так и не сумевшим организовать достойного сопротивления восставшим. Повстанческая армия, хорошо вооруженная (у крестьян имелась даже артиллерия) и  руководимая умелыми воинами, оказалась серьезным противником. Тогда главнокомандующий швабских войск Трухзес заключил перемирие с крестьянами, а затем вероломно напал на войска, входившие в состав «Черного отряда». Один из руководителей повстанцев-радикалов, Яков Рорбах, был захвачен в плен и сожжен на медленном огне. Другой, Флориан Гейер, погиб в бою.